Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcb1aP21447 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms