Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5bP21271 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myo5bP21271 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myo5bP21271 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms