Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a2P20490 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a2P20490 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms