Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms