Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P20040 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P20040 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P20040 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P20040 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms