Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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