Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps6ka1P18653 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms