Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18529 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18529 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18529 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18529 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18529 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18529 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18529 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18529 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18529 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18529 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18529 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18529 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18529 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18529 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18529 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18529 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18529 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18529 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18529 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18529 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18529 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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P18529 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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P18529 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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P18529 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18529 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18529 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18529 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18529 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18529 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18529 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18529 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18529 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18529 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18529 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18529 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18529 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18529 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P18529 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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