Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou4f1P17208 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms