Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme1P15532 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme1P15532 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme1P15532 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms