Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpsaP14206 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RpsaP14206 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RpsaP14206 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RpsaP14206 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RpsaP14206 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms