Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms