Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb1P12658 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb1P12658 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms