Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctla2aP12399 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctla2aP12399 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms