Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms