Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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