Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtsbP10605 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtsbP10605 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtsbP10605 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtsbP10605 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtsbP10605 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtsbP10605 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsbP10605 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtsbP10605 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtsbP10605 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CtsbP10605 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtsbP10605 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtsbP10605 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtsbP10605 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsbP10605 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsbP10605 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsbP10605 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsbP10605 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsbP10605 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtsbP10605 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsbP10605 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsbP10605 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsbP10605 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsbP10605 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsbP10605 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsbP10605 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsbP10605 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsbP10605 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsbP10605 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsbP10605 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsbP10605 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsbP10605 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsbP10605 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsbP10605 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsbP10605 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtsbP10605 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CtsbP10605 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CtsbP10605 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsbP10605 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsbP10605 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms