Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb4P10284 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb4P10284 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms