Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Becn2P0DM65 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms