Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms