Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa9P09631 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa9P09631 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms