Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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