Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NefmP08553 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NefmP08553 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NefmP08553 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NefmP08553 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NefmP08553 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NefmP08553 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NefmP08553 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NefmP08553 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NefmP08553 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NefmP08553 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NefmP08553 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NefmP08553 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NefmP08553 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NefmP08553 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefmP08553 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefmP08553 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefmP08553 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefmP08553 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefmP08553 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NefmP08553 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefmP08553 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefmP08553 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefmP08553 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefmP08553 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefmP08553 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefmP08553 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefmP08553 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NefmP08553 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefmP08553 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefmP08553 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefmP08553 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefmP08553 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefmP08553 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefmP08553 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefmP08553 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefmP08553 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefmP08553 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefmP08553 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefmP08553 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefmP08553 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NefmP08553 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NefmP08553 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NefmP08553 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NefmP08553 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NefmP08553 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NefmP08553 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NefmP08553 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NefmP08553 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NefmP08553 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NefmP08553 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefmP08553 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefmP08553 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefmP08553 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefmP08553 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefmP08553 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefmP08553 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefmP08553 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefmP08553 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefmP08553 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NefmP08553 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NefmP08553 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NefmP08553 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NefmP08553 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NefmP08553 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NefmP08553 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NefmP08553 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NefmP08553 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NefmP08553 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NefmP08553 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NefmP08553 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NefmP08553 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NefmP08553 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NefmP08553 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NefmP08553 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NefmP08553 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NefmP08553 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NefmP08553 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NefmP08553 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NefmP08553 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NefmP08553 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NefmP08553 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NefmP08553 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NefmP08553 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NefmP08553 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NefmP08553 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefmP08553 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefmP08553 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefmP08553 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefmP08553 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefmP08553 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefmP08553 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefmP08553 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NefmP08553 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NefmP08553 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms