Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeflP08551 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeflP08551 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeflP08551 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeflP08551 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeflP08551 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeflP08551 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeflP08551 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeflP08551 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeflP08551 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeflP08551 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeflP08551 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeflP08551 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeflP08551 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeflP08551 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeflP08551 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NeflP08551 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NeflP08551 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeflP08551 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeflP08551 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeflP08551 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeflP08551 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeflP08551 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeflP08551 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeflP08551 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeflP08551 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeflP08551 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeflP08551 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeflP08551 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeflP08551 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeflP08551 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeflP08551 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeflP08551 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeflP08551 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeflP08551 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeflP08551 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeflP08551 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeflP08551 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeflP08551 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeflP08551 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeflP08551 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeflP08551 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeflP08551 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeflP08551 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeflP08551 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeflP08551 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeflP08551 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeflP08551 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeflP08551 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeflP08551 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeflP08551 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeflP08551 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeflP08551 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms