Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9P06683 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9P06683 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9P06683 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9P06683 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9P06683 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9P06683 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9P06683 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9P06683 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9P06683 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9P06683 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9P06683 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9P06683 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9P06683 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9P06683 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9P06683 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms