Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgf3P05524 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms