Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lamc1P02468 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms