Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01800 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01800 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01800 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01800 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01800 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01800 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01800 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01800 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01800 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01800 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01800 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01800 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01800 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01800 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01800 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01800 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01800 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01800 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01800 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms