Protein–RNA interactions for Protein: P00920

Ca2, Carbonic anhydrase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca2P00920 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca2P00920 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ca2P00920 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms