Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd160O88875 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd160O88875 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd160O88875 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd160O88875 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd160O88875 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms