Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp9O88851 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms