Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arl6O88848 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arl6O88848 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6O88848 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms