Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1O88746 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1O88746 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1O88746 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tom1O88746 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tom1O88746 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tom1O88746 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tom1O88746 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms