Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms