Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3bO88509 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms