Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms