Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vti1bO88384 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms