Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt1O88346 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms