Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nid2O88322 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nid2O88322 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nid2O88322 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nid2O88322 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nid2O88322 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nid2O88322 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nid2O88322 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nid2O88322 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nid2O88322 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nid2O88322 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid2O88322 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms