Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfdp1O88271 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms