Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms