Protein–RNA interactions for Protein: O70576

Stag3, Cohesin subunit SA-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag3O70576 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag3O70576 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag3O70576 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag3O70576 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag3O70576 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag3O70576 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag3O70576 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms