Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp4O70480 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms