Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtssO70370 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtssO70370 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtssO70370 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtssO70370 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtssO70370 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtssO70370 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtssO70370 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtssO70370 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtssO70370 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtssO70370 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtssO70370 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CtssO70370 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtssO70370 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtssO70370 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtssO70370 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtssO70370 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtssO70370 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtssO70370 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms