Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox6O70238 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms