Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp2a2O55143 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms