Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms