Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms