Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms