Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms